Análisis de fragmentos
El análisis de fragmentos procedentes de estudios de Microsatélites, RFLPs, tRFLPs, AFLPs, MLPAs. etc... se realiza en un equipo de electroforesis capilar 3130xl de Applied Biosystems.
Los marcadores disponibles en la Unidad son:
GS-120 LIZ (15, 20, 25, 35, 50, 62, 80, 110, 120)
GS-500 ROX (35, 50, 75, 100, 139, 150, 160, 200, 250, 300, 340, 350, 400, 450, 490, 500)
GS-600 LIZ (20, 40, 60, 80, 100, 114, 120, 140, 160, 180, 200, 214, 220, 240, 250, 260, 280, 300, 314, 320, 340, 360, 380, 400, 414, 420, 440, 460, 480, 500, 514, 520, 540, 560, 580, 600).
Solicitud
En el caso en el que el investigador a imputar el cargo del servicio sea un nuevo usuario deberá cumplimentar y adjuntar con la primera solicitud el formulario de Datos de Facturación debidamente firmado.Con cada nueva entrega las muestras deberán ir acompañadas del impreso de solicitud debidamente cumplimentado yfirmado por el investigador o persona responsable.
FORMULARIO DE DATOS DE FACTURACIÓN
| datos_de_facturacion.doc |
FORMULARIO DE SOLICITUD DE SERVICIO DE ANÁLISIS DE FRAGMENTOS
| solicitud_af.doc |
Preparación y entrega de muestras
1. Las muestras se entregarán en tubos de 0.5 ml rotulados en la tapa y el lateral o bien en placas de 96 pocillos acompañadas de una plantilla indicando la disposición de las muestras.
- IMPORTANTE: En la asignación del nombre, utilizar solo: números , letras latinas, y los siguientes signos: - ( ) # . + . No usar espacios en blanco, ni ñ, ni letras griegas, ni otros signos distintos a los mencionados anteriormente ( como ´ ó / ), y como máximo utilizar 12 caracteres.
- Reacción completa: Incluirá los fragmentos de DNA a analizar, el marcador de tamaños adecuado y formamida desionizada para un volumen total de 12-15 μl.
- Únicamente fragmentos: Se entregará un volumen mínimo de 5 μl de muestra (a ser posible se recomienda un volumen de 10 μl para minimizar los problemas de evaporación de las muestras) indicando claramente en la hoja de solicitud el rango de tamaño de los fragmentos y los fluoroforos utilizados para el marcaje.
Envío de resultados
Por norma general, los resultados de análisis de fragmentos serán enviados a los 3-5 días contabilizados de lunes a viernes no festivos desde el momento de la entrada de las muestras al Servicio.
Ejemplo: A01_nombre muestra.fsa
Pulsar en el enlace "Begin the Peak Sacnner software download process" y a continuación registrarse en la pagina para acceder al software.
- Los resultados de los análisis de fragmentos están contenidos en ficheros con extensión ".fsa". Los resultados se envian como archivos adjuntos por email a la dirección de correo electrónico especificada por el usuario en la hoja de solicitud. Cuando el número de archivos sea superior a 12, los resultados se enviarán comprimidos en formato ".zip".
- Los ficheros se generan con la siguiente denominación:
Ejemplo: A01_nombre muestra.fsa
- Para realizar el análisis de los datos se puede emplear el software libre Peak Scanner v1.0 que se puede descargar de la página de Applied Biosystems:
Pulsar en el enlace "Begin the Peak Sacnner software download process" y a continuación registrarse en la pagina para acceder al software.