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Soy Biólogo Molecular de formación (Universidad Autónoma de Madrid). Después de acabar mis estudios universitarios, comencé mi doctorado en el Protein Design Group (PDG) en el CNB (Centro Nacional de Biotecnología-CSIC), bajo la supervisión del Prof. A. Valencia. Allí me centré en el desarrollo de herramientas de minería de textos para el estudio de rutas metabólicas (Hoffmann et al. Science Signaling-2005). También participé en BioCreative (Blaschke c. Et all. BMC Bioinformatics-2005), el concurso principal en el campo de la minería de texto.
En 2004, conseguí un puesto en el INB (Instituto Español de Bioinformática) donde adquirí una amplia formación hacia el desarrollo y la gestión de los servicios computacionales (Navas-Delgado et al. Bioinformática-2006). |
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En 2006 me trasladé al Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO), donde me uní a la Unidad de Bioinformática (Ubio). Allí, me centré en gestionar y desarrollar herramientas computacionales para los investigadores del CNIO. En particular:
Me gustaría hacer hincapié en algunas colaboraciones que reflejen mi experiencia en diversos campos dentro de la bioinformática y la biología computacional. Desarrollo de nuevas herramientas web para la integración de información biológica (Cases et al. NAR-2007). Bases de datos web (Andrés León et al. NAR-2009, Andrés León et al. Database-2015). Estudio de interacciones proteína-proteína (Pazos et al, Methods Mol. B-2008) y análisis de redes de interacción de proteínas. (García-Jiménez, PloS One-2010).
Además, he colaborado en diversos análisis con RNAs no codificantes (Frenkel-Morgenstern, NAR-2013), en particular con miRNAs y su contribución en el cáncer como el linfoma difuso de células B grandes (Martín-Pérez, Leucemia-2012) o el cáncer de mama (Tanic et al. British Journal of Cancer, 2013).
En 2013, me incorporé al IBIS (Instituto de Biomedicina de Sevilla) como responsable técnico de la unidad de bioinformática, dentro del grupo de biología computacional y bioinformática (CbBio) a cargo de la Dr. Ana M. Rojas. Dentro de la unidad me encargué del análisis de todo tipo de datos, tanto experimentales (transcriptómica, metilación, ChipSeq, proteómica), como clínicos. Además de la creación y administración de una infraestructura computacional para el centro.
Desde 2015, soy el responsable de bioinformática del Instituto de Parasitología y Biomedicina “Lopez-Neyra”. Mis funciones principales son ayudar a los investigadores del centro o externos a obtener resultados relevantes a partir de los diversos experimentos. Para más información, consulte la página de servicios.
- Administración y creación de recursos computacionales (tanto en hardware y software) para servir a las demandas de investigadores experimentales y usuarios avanzados pertenecientes a grupos computacionales.
- Desarrollo de software personalizado para grupos experimentales.
- Análisis a gran escala de datos experimentales en el marco de diversas colaboraciones con investigadores experimentales.
Me gustaría hacer hincapié en algunas colaboraciones que reflejen mi experiencia en diversos campos dentro de la bioinformática y la biología computacional. Desarrollo de nuevas herramientas web para la integración de información biológica (Cases et al. NAR-2007). Bases de datos web (Andrés León et al. NAR-2009, Andrés León et al. Database-2015). Estudio de interacciones proteína-proteína (Pazos et al, Methods Mol. B-2008) y análisis de redes de interacción de proteínas. (García-Jiménez, PloS One-2010).
Además, he colaborado en diversos análisis con RNAs no codificantes (Frenkel-Morgenstern, NAR-2013), en particular con miRNAs y su contribución en el cáncer como el linfoma difuso de células B grandes (Martín-Pérez, Leucemia-2012) o el cáncer de mama (Tanic et al. British Journal of Cancer, 2013).
En 2013, me incorporé al IBIS (Instituto de Biomedicina de Sevilla) como responsable técnico de la unidad de bioinformática, dentro del grupo de biología computacional y bioinformática (CbBio) a cargo de la Dr. Ana M. Rojas. Dentro de la unidad me encargué del análisis de todo tipo de datos, tanto experimentales (transcriptómica, metilación, ChipSeq, proteómica), como clínicos. Además de la creación y administración de una infraestructura computacional para el centro.
Desde 2015, soy el responsable de bioinformática del Instituto de Parasitología y Biomedicina “Lopez-Neyra”. Mis funciones principales son ayudar a los investigadores del centro o externos a obtener resultados relevantes a partir de los diversos experimentos. Para más información, consulte la página de servicios.
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