Cross-phenotype analysis of Immunochip data identifies KDM4C as a relevant locus for the development of systemic vasculitis.
Ortiz-Fernández L, Carmona FD, López-Mejías R, González-Escribano MF, Lyons PA, Morgan AW, Sawalha AH, Smith KGC, González-Gay MA, Martín J.
Ann Rheum Dis. Doi: 10.1136/annrheumdis-2017-212372.
RESUMEN
Las vasculitis sistémicas representan un grupo heterogéneo de enfermedades que afectan a los vasos sanguíneos. Estas patologías presentan una etiología compleja en la que la interacción entre factores ambientales y genéticos es esencial para su desarrollo y progresión. El objetivo del presente trabajo fue investigar el componente genético común entre estas enfermedades para lo cual, hemos realizado el primer meta-análisis combinando datos genéticos de cuatro vasculitis con diferentes cuadros clínicos. Para identificar genes comunes para el desarrollo de vasculitis, se analizaron datos genéticos de 2.465 pacientes diagnosticados con arteritis de células gigantes (GCA), arteritis de Takayasu (TAK), vasculitis asociadas a ANCA (AAV) o vasculitis IgA (IgAV) y 4.632 controles sanos. Posteriormente, interrogamos las posibles consecuencias funcionales de las variantes genéticas que se encontraran asociadas usando bases de datos públicas de anotación funcional. Los resultados del estudio mostraban que la señal de asociación más fuerte correspondió con un polimorfismo intergénico localizado entre los genes HLA-DQB1 and HLA-DQA2 (rs6932517, P=4.16E-14, OR=0.74). Esta variante presenta un moderado desequilibrio de ligamiento con las asociaciones de HLA específicas de cada enfermedad por lo que se le podría considerar como un marcador de ellas. Además, también identificamos el gen KDM4C como un factor de riesgo común entre las cuatro vasculitis (rs16925200, P=6.23E-07, OR=1.75). Este gen codifica una histona desmetilasa que se encuentra involucrada en el control epigenético de la expresión génica. En conclusión, a través de un análisis en el que hemos combinado datos genéticos de diferentes patologías, hemos identificado el gen KDM4C como un nuevo gen de riesgo común entre las vasculitis sistémicas. Estos resultados son consistentes con las crecientes evidencias de que los mecanismos epigenéticos juegan un papel crucial en el desarrollo de las enfermedades complejas inmuno-mediadas.
ABSTRACT
Systemic vasculitides represent a heterogeneous group of rare complex diseases of the blood vessels with a poorly understood aetiology. To investigate the shared genetic component underlying their predisposition, we performed the first cross-phenotype meta-analysis of genetic data from different clinically distinct patterns of vasculitis. Immunochip genotyping data from 2,465 patients diagnosed with giant cell arteritis (GCA), Takayasu's arteritis (TAK), ANCA-associated vasculitis (AAV), or IgA vasculitis.
