Un meta-GWAS combinando esclerosis sistémica y enfermedad de Crohn identifica cuatro nuevos loci de susceptibilidad compartidos en estas dos enfermedades.

González-Serna D, Ochoa E, López-Isac E, Julià A, Degenhardt F, Scleroderma Genetic Consortium,Ortego-Centeno N, Radstake TRDJ, Franke A, Marsal S, Mayes MD, Martín J, Márquez A.

Scientific reports. 2020 Feb 5;10(1)

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31796083

RESUMEN

Gracias a los estudios de asociación de genoma completo (del inglés "Genome-wide association studies"; GWASs) se han identificado un buen número de loci de riesgo asociados con la esclerosis sistémica (SSc) y la enfermedad de Crohn (CD), algunos de los cuales confieren susceptibilidad a sufrir ambas enfermedades. Con el fin de identificar nuevos loci de riesgo compartidos entre estas dos enfermedades mediadas por el sistema inmune, realizamos un meta-análisis incluyendo datos GWAS de 5,734 pacientes con SSc, 4,588 pacientes con CD y 14,568 controles de origen europeo. Identificamos 4 nuevos loci compartidos entre estas dos enfermedades: IL12RB2, IRF1/SLC22A5, STAT3 y un locus intergénico en 6p21.31. Las variantes incluidas en estos loci mostraban efectos alélicos opuestos en las dos enfermedades analizadas, y todos ellos mostraban un efecto significativo en la expresión génica. Además, se observó un enriquecimiento en las vías de señalización de la familia de IL-12 e interferón tipo I para los loci de riesgo comunes identificados. En conclusión, a través del primer meta-análisis combinado de SSc y CD hemos identificado variantes genéticas con efectos pleiotrópicos en dos enfermedades mediadas por el sistema inmune, pero clínicamente diferentes. El hecho de que todos estos polimorfismos tengan efectos alélicos opuestos en SSc y CD revela la complejidad de los mecanismos moleculares a través de los cuales estos polimorfismos afectan a ambas enfermedades.

Gráficos de Manhattan representando los resultados del meta-análisis combinado de esclerosis sistémica y enfermedad de Crohn, considerando efectos alélicos en la misma dirección (A) y efectos alélicos en direcciones opuestas (B). Los loci seleccionados para la fase de validación están escritos en negro. El umbral de significación a nivel de genoma completo (p < 5 × 10^-8 ) está representado como una línea roja. El umbral de significación establecido para el meta-análisis combinado (p < 1 × 10^-5 ) está representado como una línea azul