Prevalencia de SARS-CoV-2 y co-infección con malaria durante la primera ola de la pandemia (el caso de Burkina Faso).

Diana López-Farfán, R. Serge Yerbanga, Marina Parres-Mercader, Manuela Torres-Puente, Inmaculada Gómez-Navarro, Do Malick Soufiane Sanou, Adama Franck Yao, Jean Bosco Ouédraogo, Iñaki Comas, Nerea Irigoyen, Elena Gómez-Díaz..

RELEVANCIA: Artículo publicado en la revista Frontiers in Public Health, en la colección especial "Interacciones entre COVID-19 y malaria". Revista con un índice de impacto de 6.46 y posicionada en el cuartil 1 del área de investigación Salud ocupacional, pública y del medio ambiente (posición 18 de 182).

RESUMEN

África acumula el 1,5% de los casos y el 2,7% de las muertes por COVID-19 en todo el mundo. Esta baja incidencia se ha atribuido en parte a la limitada capacidad de realización de test diagnóstico en la mayoría de los países. Además, la población de muchos países africanos corre un alto riesgo de infección por enfermedades infecciosas endémicas, como la malaria. Nuestro objetivo fue determinar la prevalencia y las variantes circulantes de SARS-CoV-2, así como la frecuencia de co-infección con el parásito de la Malaria, Plasmodium falciparum. Para ello se realizaron pruebas serológicas y exámenes microscópicos a 998 voluntarios de diferentes edades y sexos en una muestra de población aleatoria y estratificada de Burkina Faso. Además, se tomaron muestras nasofaríngeas para la detección molecular de SARS-CoV-2 y la secuenciación del genoma viral. Los resultados confirman la baja incidencia de SARS-CoV-2, con una seroprevalencia de 3.2% y una positividad por PCR de 2,5% durante el periodo de muestreo. Los análisis de secuencias genómicas de 13 aislados de SARS-CoV-2 que circulaban en Burkina Faso durante la primera ola de la pandemia se asignaron a los linajes A.19, A.21, B.1.1.404, B.1.1.118, B.1 y se agruparon en tres clados 19B, 20A y 20B. Como resultado importante, se reportaron 19 casos de co-infección de COVID-19 y malaria, la mayoría en niños y adolescentes. Este es el primer estudio poblacional de SARS-CoV-2 y malaria realizado en Burkina faso durante la primera ola de la pandemia que proporciona una estimación real de la prevalencia y circulación de variantes de SARS-CoV-2 en este país de A´frica subsahariana, el cual además evidencia la frecuencia no despreciable de co-infección con malaria en las comunidades africanas y las consecuencias que ello puede tener desde un punto de vista de salud pública.

(A) Prevalencia de SARS-CoV-2 y malaria. (B) Representación de casos positivos en la muestra poblacional. (C) Representación de casos de co-infección en el set de muestras positivas para SARS-CoV-2.

https://doi.org/10.3389/fpubh.2022.1048404