La proteína RBP33 amortigua la transcripción generalizada en tripanosomas.

Claudia Gómez-Liñán, Elena Gómez-Díaz, Gloria Ceballos-Pérez, Sandra M. Fernández-Moya y Antonio M. Estévez

Relevancia:
Este artículo se ha publicado en la revista Nucleic Acids Research (NAR), una de las revistas más prestigiosas en el extenso campo de la Biología Molecular. El factor de impacto de NAR es de 19.16, y se encuentra dentro del primer decil dentro de la categoría "Bioquímica y Biología Molecular"


RESUMEN

La mejora tanto de las técnicas de secuenciación masiva como de las herramientas bioinformáticas necesarias para el análisis de la expresión génica ha puesto de manifiesto que los genomas se transcriben de forma ubicua. Esta transcripción generalizada da lugar a moléculas de ARN (transcritos) aparentemente improductivas y antisentido que se generan prácticamente a partir de cualquier contexto genómico. Se sabe que existen maquinarias proteicas encargadas de destruir estos ARN potencialmente perjudiciales, pero poco se conoce sobre los factores que controlan este proceso. En este trabajo hemos caracterizado la función de una proteína de unión a ARN llamada RBP33 en Trypanosoma brucei, el parásito que causa la enfermedad del sueño en humanos. RBP33 es una proteína esencial para el parásito; además, es específica de tripanosomas y parásitos relacionados (leishmanias), no se encuentra en el resto de organismos eucariotas. Cuando silenciamos la expresión de RBP33 mediante ribointerferencia, se producen cambios significativos en la expresión de casi la mitad de los genes del genoma del parásito, dando lugar a un aumento muy acusado de transcritos no productivos y antisentido que provienen de zonas genómicas que están silenciadas en condiciones fisiológicas. Analizamos a escala genómica la accesibilidad de la cromatina en parásitos con o sin RBP33, y no observamos alteraciones significativas en la cromatina que pudieran explicar el aumento generalizado de transcritos antisentido. Por el contrario, sí detectamos cambios evidentes en la tasa de degradación de estos ARNs que indican que RBP33 está encargada de marcarlos para su destrucción. El hecho de que RBP33 sea una proteína esencial y aparentemente única en tripanosomas y leishmanias la convierte en una diana prometedora para terapia, y también en un atractivo campo de estudio para entender la evolución del procesamiento del ARN en eucariotas.

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https://doi.org/10.1093/nar/gkac1123