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Instituto de Parasitología y Biomedicina
"López - Neyra"
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Imagen de Santiago Ramon y Cajal

Interacciones ARN–ARN inter- e intramoleculares modulan la regulación mediada por la UTR 3' de la traducción en el virus del Nilo Occidental.

 

Romero-López, C.; Roda-Herreros, M.; Berzal-Herranz, B.; Ramos-Lorente, S.E. and Berzal-Herranz, A.

 

Relevancia: Este trabajo de investigación fue publicado en la revista International Journal of Molecular Sciences, con un índice de impacto (IF) de 6.208 y ubicada en el primer cuartil de la categoría BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY"

RESUMEN

Los virus RNA dependen de elementos estructurales genómicos para llevar a cabo las funciones necesarias para completar el ciclo viral. Estos elementos participan en una red dinámica de interacciones RNA–RNA que determinan el plegamiento global del RNA genómico y que es responsables de la regulación fina de la replicación y la traducción virales, así como de la transición entre estos procesos. Los genomas de los miembros del género Flavivirus se caracterizan por presentar una 3' UTR compleja en la que se definen una serie de elementos estructurales de RNA universalmente conservados entre los aislados de cada especie. El presente trabajo aporta pruebas de la existencia de nuevas interacciones intra e intermoleculares RNA–RNA entre elementos estructurales de RNA de la 3' UTR del genoma del virus del Nilo Occidental. Las interacciones intermoleculares pueden visualizarse in vitro mediante la formación de dímeros moleculares que implican la participación de al menos los elementos SLI y 3'DB. Es muy interesante que la 3' UTR del virus del dengue, que carece del elemento SLI, forma dímeros moleculares con menor eficiencia, posiblemente porque ocurren a través de un único sitio de interacción, que hipotetizamos es el 3'DB. El análisis funcional de mutantes de secuencia o deleción reveló una relación inversa entre la eficiencia de dimerización de la 3' UTR y la eficiencia de la traducción viral en cultivos celulares. Por lo tanto, podría existir una red de interacciones RNA–RNA en la que intervienen elementos estructurales de la 3' UTR, lo que contribuiría a regular la traducción viral.

Imagen

Fig: Esquema representativo de la estructura de la 3' UTR del RNA genómico del virus del Nilo Occidental. Se muestra la secuencia y principales elementos estructurales de esta región. Así mismo se muestran motivos de secuencia que han sido implicados en interacciones RNA–RNA a larga distancia. La figura recoge los principales resultados derivados del análisis estructural descrito en este trabajo derivados de la aplicación de la técnica HMX. Los círculos verdes indican un aumento o disminución significativo (p < 0,1) de 0,4 unidades de reactividad NMIA entre la conformación monomérica y la dimérica. Los datos de reactividad se utilizaron para predecir con el software RNAStructure, un modelo estructural teórico, en el que se indican las interacciones intra y/o intermoleculares que se describen en este trabajo (representadas como líneas discontinuas naranjas). Las líneas discontinuas negras indican los pseudonudos (PK) previamente definidos.


https://doi.org/10.3390/ijms24065337

 

 

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