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Instituto de Parasitología y Biomedicina
"López - Neyra"
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mRNA FORMATION AND FUNCTION



Jefe de grupo
    • Carles María Suñé Negre     
        email: csune (@ipb.csic.es)
        Tlf: 958181645



    Personal Investigador Predoctoral
    • Sofia Boyero Corral     


    Personal Autorizado
    • Ana María Cerón Moreno     
    • Younes El Yousfi      
    • Cristina Moreno Castro     
    • Silvia Prieto Sánchez     

     

    LINEAS DE INVESTIGACIÓN


     

    Resumen

     

    El proceso estrechamente regulado del splicing alternativo del RNA mensajero precursor (pre-mRNA) es un mecanismo clave para aumentar el número y la complejidad de las proteínas codificadas por el genoma. Los resultados de los análisis de expresión génica basados en la secuenciación masiva sugieren que más del 90% de los genes humanos multiexónicos se encuentran regulados por splicing alternativo. Cambios en la regulación en cis o en trans de este proceso pueden provocar múltiples patologías como consecuencia de un procesamiento aberrante del pre-mRNA, lo que subraya la importancia fundamental de este proceso de regulación de la expresión génica. Los datos experimentales generados durante los últimos años establecen que la transcripción y el splicing están acoplados física y funcionalmente y que este acoplamiento puede ser un aspecto esencial de la regulación del splicing constitutivo y alternativo. Recientes avances en la comprensión de la regulación de la transcripción y del splicing han descubierto la existencia de múltiples interacciones entre los componentes de ambos tipos de maquinarias. Estas interacciones ayudan a explicar el acoplamiento funcional de la transcripción mediada por la RNA polimerasa II y el splicing alternativo del pre-mRNA para una eficiente regulación molecular de la expresión génica.



    A pesar de numerosos esfuerzos, siguen siendo numerosas las preguntas sobre la importancia funcional y el impacto global de este acoplamiento en la homeostasis celular y en el organismo, así como sus mecanismos subyacentes. Además de estudiar los eventos moleculares que gobiernan las interacciones entre las maquinarias de la transcripción y el splicing, queremos ir más allá y proporcionar nuevos conocimientos sobre los mecanismos moleculares que actúan en situaciones patológicas. Nuestra investigación pretende dilucidar los mecanismos de transcripción y regulación del procesamiento del pre-RNA, lo cual puede proporcionar nuevos e importantes conocimientos de los eventos moleculares que conducen a trastornos neurológicos y linfoproliferativos. También queremos identificar y caracterizar los componentes celulares de estas importantes vías que deben servir para establecer las bases de la comprensión de sus funciones. Es muy probable que a medida que esto se logra también aprendamos importantes lecciones sobre los mecanismos de regulación de la transcripción y el splicing alternativo de los genes celulares.







     

    1. Regulación de la transcripción y el splicing alternativo en el sistema nervioso

     

    Estudiamos la función de una familia de factores que intervienen en transcripción y splicing y que contienen repeticiones en tándem de dominios WW y FF en neurogénesis, así como el mecanismo molecular por los que estos factores pueden afectar la transcripción y el splicing alternativo de importantes genes que pueden contribuir a trastornos neurológicos.









     

    2. Regulación de la transcripción y el splicing alternativo en el cáncer

     

    Estudiamos la relación existente entre la regulación de la transcripción y el splicing alternativo de importantes factores del spliceosoma y el desarrollo de neoplasias hematológicas. Además estamos iniciando nuevos proyectos para estudiar la regulación del procesamiento del pre-mRNA en la reparación del DNA, que es un proceso esencial para mantener la integridad del genoma, con el fin de obtener nuevos conocimientos sobre el mecanismo de la transformación neoplásica.









     

    3. Regulación de la transcripción y el splicing alternativo en células vivas

     

    Llevamos a cabo estudios de la organización espacial y la dinámica de la transcripción y procesamiento del pre-mRNA en el compartimentado núcleo eucariota, que son fundamentales para entender cómo se ejerce la regulación de la expresión génica en la célula.









     


    ORGANISMOS FINANCIADORES ÚLTIMOS 5 AÑOS

    - DEFINIENDO MECANISMOS DE ACOPLAMIENTO ENTRE TRANSCRIPCION Y SPLICING VINCULADOS A ENFERMEDADES DEGENERATIVAS. PROYECTO, PN2017 - PROY I+D+I - PRG. RETOS DE LA SOCIEDAD, Ref: BFU2017-89179-R, (2018 - 2020).

    - Acoplamiento funcional entre la transcripción y el splicing. PROYECTO, PN2014 - PROY I+D+I - PRG. RETOS DE LA SOCIEDAD, Ref: BFU2014-54660-R, (2015 - 2017).

    - Regulación del splicing co-transcripcional en genes de procesos biológicos esenciales. PROYECTO, Proyectos de Excelencia 2012 Junta de Andalucía, Ref: P12-BIO-2515, (2014 - 2018).

    - Papel de TCERG1 de la dendritogénesis de células neuronales. PROYECTO, , Ref: 201320E006, (2013 - 2015).

    - ACOPLAMIENTO DE LA TRANSCRIPCION Y EL SPLICING ALTERNATIVO DE LOS PRE-MRNAS. PROYECTO, PN2011 - I.F.N.O.- BIOLOGÍA FUNDAMENTAL Y DE SISTEMAS, Ref: BFU2011-24577, (2012 - 2014).

    - Acoplamiento bioquímico y funcional entre la transcripción, el procesamiento de los RNAs y la arquitectura nuclear. PROYECTO, PLAN ANDALUZ DE INVESTIGACION, Ref: P09-CVI-4626, (2010 - 2014).

     

     

    PUBLICACIONES ÚLTIMOS 5 AÑOS

    -Juan Pablo Muñoz-Cobo; Noemí Sánchez-Hernández; Sara Gutiérrez; Younes El Yousfi; Marta Montes; Carme Gallego; Cristina Hernández-Munain; Carlos Suñé, Transcriptional Elongation Regulator 1 Affects Transcription and Splicing of Genes Associated with Cellular Morphology and Cytoskeleton Dynamics and Is Required for Neurite Outgrowth in Neuroblastoma Cells and Primary Neuronal Cultures, Molecular Neurobiology, 2017, Vol. 54: 7808-7823, ARTICULO, Id:1545

    -Suñé-Pou, M.; Prieto-Sánchez, S.; Boyero-Corral, S.; Moreno-Castro, C.; Yousfi, Y.E.; Suñé-Negre, J.M.; Hernández-Munain, C.; Suñé, C., Targeting splicing in the treatment of human disease, GENES, 2017, Vol. 8: 3-87, ARTICULO DE REVISION, Id:1537

    -Sánchez-Hernández, N.; Prieto-Sánchez, S.; Moreno-Castro, C.; Muñoz-Cobo, J.P.; El Yousfi, Y.; Boyero-Corral, S.; Suñé-Pou, M.; Hernández-Munain, C.; Suñé, C., Targeting proteins to RNA transcription and processing sites within the nucleus, International Journal of Biochemistry and Cell Biology, 2017, Vol. 91: 194-202, ARTICULO DE REVISION, Id:1536

    -Fàbregas, A.; Prieto, S.; Suñé-Pou, M.; Boyero-Corral, S.; Ticó, J.R.; García-Montoya, E.; Pérez-Lozano, P.; Miñarro, M.; Suñé-Negre, J.M.; Hernández-Munain, C.; Suñé, C., Improved formulation of cationic solid lipid nanoparticles displays cellular uptake and biological activity of nucleic acids, International journal of pharmaceutics, 2017, Vol. 516: 39-44, ARTICULO, Id:1517

    -Sánchez-Hernández N; Boireau S; Schmidt U; Muñoz-Cobo JP; Hernández-Munain C; Bertrand E; Suñé C, The in vivo dynamics of TCERG1, a factor that couples transcriptional elongation with splicing, RNA, 2016, Vol. 22: 571-582, ARTICULO, Id:1376

    -Becerra S; Andrés-León E; Prieto-Sánchez S; Hernández-Munain; Suñé C, Prp40 and early events in splice site definition, Wiley Interdisciplinary Reviews - RNA, 2016, Vol. 7: 17-32, ARTICULO DE REVISION, Id:1363

    -Becerra, S.; Montes, M.; Hernández-Munain, C.; Suñe, C., Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (PRPF40B) associates with SF1 and U2AF65and modulates alternative pre-mRNA splicing in vivo, RNA, 2015, Vol. 21: 438-457, ARTICULO, Id:1452

    -Montes, M.; Coiras, M.; Becerra, S.; Moreno-Castro, C.; Mateos, E.; Majuelos, J.; Oliver, F.J.; Hernández-Munain, C.; Alcamí, J.; Suñé, C., Functional consequences for apoptosis by transcription elongation regulator 1 (TCERG1)-Mediated Bcl-x and Fas/CD95 Alternative Splicing, PLoS ONE, 2015, Vol. 10: 10-e0139812, ARTICULO, Id:1420

    -Fàbregas, A.; Sánchez-Hernández, N.; Ticó, J.R.; García-Montoya, E.; Pérez-Lozano, P.; Suñé-Negre, J.M.; Hernández-Munain, C.; Suñé, C.; Miñarro, M., A new optimized formulation of cationic solid lipid nanoparticles intended for gene delivery: Development, characterization and DNA binding efficiency of TCERG1 expression plasmid, International journal of pharmaceutics, 2014, Vol. 473: 270-279, ARTÍCULO, Id:1182


     

     

    TESIS DOCTORALES ÚLTIMOS 5 AÑOS

     

    2017

    Juan Pablo Muñoz-Cobo Belart

    Análisis del silenciamiento génico de TCERG1 mediante Exon Arrays

    Instituto de Parasitología y Biomedicina López Neyra CSIC

     

     
    2015

    Soraya Becerra Ortiz

    Caracterización bioquímica y funcional del factor de transcripción y splicing PRPF40B

    IPBLN CSIC

     

     

     

     


    Sede: Parque Tecnológico de Ciencias de la Salud, Avda. del Conocimiento, 17. 18016 Armilla (Granada)(ESPAÑA). TEL:+34 958181621. FAX:+34 958181632

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