Control del
procesamiento del pre-mRNA en la levadura Saccharomyces cerevisiae.
Responsable: Josep Vilardell
Centre de
Regulació Genómica
Pg. Marítim 37-49
08003 Barcelona.
Teléfono: 93
2240916/22 Fax: 93 2240899
http://www.crg.es/proyectos.asp?WebIdioma=Angles&ingid=23
Josep Vilardell, Jefe
de Grupo, josep.vilardell@crg.es
Mireia Bragulat, Becaria
Predoctoral, mireia.bragulat@crg.es
Sara Macías, Becaria
Predoctoral, sara.macias@crg.es
Judit Peix, Técnica
de laboratorio, judit.peix@crg.es
Líneas de Investigación:
Las interacciones RNA-proteína son un elemento crucial de sistemas moleculares como el ribosoma o el spliceosoma, y se sitúan en el centro de la regulación de la expresión génica. Un determinante fundamental de estas interacciones es el dinamismo estructural del RNA. Sin embargo, y a pesar de su relevancia, se sabe muy poco del papel que la estructura del RNA juega en el control del splicing de pre-mRNAs. Este potencial regulador sido demostrado en el gen RPL30 de Saccharomyces cerevisiae. El producto de este gen esencial, la proteína ribosomal L30, auto-regula el procesamiento del transcrito de su propio gen uniéndose a una estructura que contiene el sitio de splicing 5' (5'SS). El sistema L30/RPL30 de regulación del splicing tiene además un especial interés porque L30 inhibe el splicing durante los primeros pasos del ensamblaje del spliceosoma, de manera que permite explorar las interacciones dinámicas que ocurren durante el splicing y cómo éstas pueden ser reguladas, procesos ambos muy poco entendidos. El principal interés de nuestro laboartorio, el análisis del efecto del entorno molecular del 5'SS en su reconocimento y en el procesamiento del RNA que lo contiene, empleando S. cerevisiae como sistema modelo, se fundamenta en este sistema (Vilardell y Warner, Genes & Dev. 1994 8:211, Vilardell et al., Mol. Cell 2000 5:761). Se siguen dos aproximaciones principales, de tipo genético y bioquímico respectivamente, de las que ya se dispone de datos preliminares que las validan. Se ha iniciado el diseZo de screenings genéticos para identificar genes cuyos productos estén involucrados en la regulación del splicing de transcritos especiales, y se van a diseccionar las interacciones moleculares que intervienen en esta regulación mediante el uso de sistemas in vitro y reactivos específicos, incluyendo el empleo de nucleótidos fotosensibles en posiciones determinadas del sustrato. Las modificaciones del sustrato se basarán además en el empleo de diferentes estructuras presentes a lo largo de la cadena y que pueden ser reconocidas por distintos factores (por ejemplo MS2, del fago homónimo).