Responsable:
Modesto Orozco López
Institut
de Recerca Biomédica
Parc
Cientific de Barcelona
Josep
Samitier 1-5. Barcelona 08028
Teléfono:
93 403 71 56 Fax: 93 403 71 57
Modesto Orozco, Catedrático
de Universidad, modesto@mmb.pcb.ub.es
Francisco Javier
Luque, Catedrático de Universidad, javier@far1.far.ub.es
Xavier
de la Cruz, Investigador Senior ICREA. xavier@mmb.pcb.ub.es
Josep
Lluis Gelpí. Profesor Asociado. gelpi@mmb.pcb.ub.es
Actividad Científica
Líneas de Investigación:
D)
Estudio de
formas inusuales del ácidos nucleicos de potencial impacto biomédico y
biotecnológico.
Nuestro grupo ha venido trabajando los últimos 10
años en el estudio de formas inusuales de ácidos nucleicos mediante técnicas
computacionales de simulación molecular. Estructuras analizadas incluyen
triplexes, cuadrúplexes, híbridos de DNA y RNA con otros polímeros de ácidos
nucleicos. Hemos también descrito nuevas maneras de estabilizar o hacer más
específicas algunas estructuras inusuales de especial importancia biomédica.
Todo ello se ha realizado siempre en colaboración con colegas experimentales.
Por su especial importancia queremos señalar las colaboraciones con los grupos
de Carlos González y Ramón Eritja.
E)
Minería de
datos genómicos
En esta línea tratamos de desarrollar
herramientas para el procesado de datos genómicos. Son de destacar los estudios
sobre predicción de impacto estructural de splicing alternativo, los de
predicción de carácter patológico de mutaciones y los de muestreo de bases de
datos para la detección de regiones dianas para formación de triple hélice.
F)
Estudios de
reconocimiento molecular en proteínas
Hemos analizado el reconocimiento molecular
en proteínas de interés biomédico. Muchos de estos proyectos están enmarcados
en estrategias de diseño de fármacos asistidos por ordenador. Es de destacar en
este campo el desarrollo de algoritmos de docking y de caracterización de
centros activos.
G)
Desarrollo de
algoritmos para el estudio de sistemas modelo
Aquí nuestro esfuerzo se ha centrado en el
campo de la descripción de las interacciones moleculares y de la solvatación.
Proyectos en vigor:
Subvención para Grups de Recerca Consolidats. 2001SGR.
Generalitat de Catalunya. 2002-2004.
Investigador principal M.Orozco.
Ayuda fundación Ramón Areces. Estudios Bioinformaticos de
las mutaciones patológicas. Investigador principal M.Orozco.
Red Catalana de Bioinformatica. Direcció General de Recerca.
2003-2004.
BIO2003-06848. MCyT. Plan Nacional de Biotecnología
“Simulaciones Teoricas de formas inusuales del DNA. Implicaciones
biotecnológicas y biomédicas”.
2004-2006.
Investigador principal M.Orozco.
Fundación BBVA. Acción especial de Bioinformatica. “Design of new oligonucleotide-based antigene and antisensetherapies”.
Fundación Genoma España. Nodo Español de referencia en Bioinformática
Estructural. 2003-2006.
Publicaciones relevantes (1999-2004)
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-
R.Soliva, F.J.Luque y M.Orozco. “Can
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- E.
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C.A.Laughton. “Observation of a spontaneous base pair breathing event in the
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-
B.Hernández, F.J.Luque y M.Orozco.
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R.Eritja, E.Ferrer, R.Güimil y M.Orozco.
“Modified Oligonucleotides with triple-helix stabilization properties”. Nucleosides and Nucleotides. 18,
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B.Hernández, R.Soliva, F.J.Luque y M.Orozco.
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-
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- C.Busquets,
B.Merinero, E.Christensen, J.Gelpí, J.Campistol, M.Pineda, E.Fernández-Alvárez,
J.Prats, A.Sans, R.Arteaga, M.Martí, J.Campos, M.Martínez-Pardo,
A.Martínez-Bermejo, M.L. Ruiz-Falcó, J.Vaquerizo, M.Orozco,
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