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Instituto de Parasitología y Biomedicina
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Imagen de Santiago Ramon y Cajal

Los factores de transcripción TBP y SNAP50 se unen específicamente a la secuencia promotora Pr77 de los retrotransposones sin LTR de tripanosomátidos.

 

Francisco Macías, Raquel Afonso-Lehmann, Patricia Carreira, M Carmen Thomas.

 

Parasites and Vectors 2021, Jun9;14(1):313.



RESUMEN

Los genomas de tripanosomátidos están colonizados por elementos de ADN móviles activos e inactivos, como los retrotransposones LINE, SINE-like, SIDER y DIRE. Todos estos elementos comparten una secuencia de 77 nucleótidos de longitud en sus extremos 5 ', llamada Pr77, la cual activa la transcripción génica vía RNA polimerasa II, generando tránscritos abundantes los cuales son traducibles y carecen de Spliced Leader.  Hasta la fecha se desconocen los factores de transcripción que median la transcripción de Pr77 por lo que su estudio e identificación de los mismos permitirá dilucidar cómo estos retrotranspososns se movilizan dentro de los genomas de tripanosomátidos y cuál es su participación en los procesos de regulación génica de este parásito humano.

Este estudio describe la identificación de TBP (TATA-binding protein) y SNAP50 (Small Nuclear RNA-Activating Protein-50 kDa) como parte del complejo ADN-proteína formado por la secuencia promotora Pr77 y proteínas nucleares de Trypanosoma cruzi. TBP establece un contacto directo y específico con la secuencia Pr77. Los sitios de acoplamiento preferencial de TBP en Pr77 son la región que comprende el Downstream Promoter Element (DPE) así como la secuencia localizada corriente abajo del DPE. TBP se une cooperativamente a Pr77 (coeficiente de Hill = 1,67) y a ambas cadenas de la secuencia de Pr77, mientras que la conformación de esta secuencia, altamente estructurada, no está involucrada en la unión de TBP. La unión directa de SNAP50 a la secuencia promotora Pr77 es débil y puede estar mediada por interacciones proteína-proteína a través de otras proteínas nucleares del parásito.

Esta es la primera descripción de factores de transcripción que se unen a un promotor de un retrotransposón en tripanosomátidos.  Aunque se requieren más estudios para conocer los mecanismos básicos necesarios para la transcripción génica vía ARN polimerasa II en Trypanosoma cruzi, estos resultados constituyen un avance relevante en el proceso de transcripción que tiene lugar en este organismo


Imagen

Fig: Los factores de transcripción TBP y SNAP50 se unen específicamente a la secuencia promotora Pr77 de los retrotransposones L1Tc, NARTc y DIRE de tripanosomátidos


doi: 10.1186/s13071-021-04803-5.

 

 

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